任務：
本院隸屬天主教輔仁大學，於創院初期對於教學、研究及服務的創新，以結合校園資源，投入多元的元素，整合各醫療部科研究特色及鼓勵與校內各相關學院的跨院合作。期望從基礎研究至臨床醫學研究，實驗室到病人的雙向及全面的研究，進而提升醫療品質，帶動醫療健康科技發展。本院設有研究副院長，並以醫學研究部為主責單位，執行全院研究相關事務及成果統計。
目標：
本院以天主教大學精實學術研究態度，促進醫學各領域之研究與發展為學術研究之使命。為達成目標，研究方向除了與校內多個相關學院（如醫學、理工、民生、管理、藝術學院等）在研究領域上取得交集合作外，院內臨床部科間亦要積極的跨部科合作研究。醫學研究部將協助全院執行研究工作，除了本院院內持續推動研究工作外，更將積極與院外學術研究機構接軌，協助同仁爭取科技部、衛福部、國衛院、中研院等機構的合作計畫案，進而創造豐碩的研究量能，以造福祉。